Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tm9sf3Q9ET30 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms