Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Usp29Q9ES63 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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