Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms