Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG0

Lima1, LIM domain and actin-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lima1Q9ERG0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lima1Q9ERG0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms