Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhojQ9ER71 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms