Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms