Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tlr1Q9EPQ1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms