Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne8Q9DC53 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne8Q9DC53 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne8Q9DC53 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne8Q9DC53 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne8Q9DC53 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne8Q9DC53 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne8Q9DC53 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne8Q9DC53 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne8Q9DC53 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne8Q9DC53 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne8Q9DC53 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne8Q9DC53 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne8Q9DC53 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne8Q9DC53 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne8Q9DC53 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne8Q9DC53 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne8Q9DC53 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne8Q9DC53 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cpne8Q9DC53 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cpne8Q9DC53 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cpne8Q9DC53 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cpne8Q9DC53 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cpne8Q9DC53 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cpne8Q9DC53 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cpne8Q9DC53 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne8Q9DC53 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms