Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Syde1Q9DBZ9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms