Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tm9sf1Q9DBU0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms