Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC0

Selenoo, Selenoprotein O, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenooQ9DBC0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelenooQ9DBC0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SelenooQ9DBC0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms