Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnn3Q9DAW9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnn3Q9DAW9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnn3Q9DAW9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnn3Q9DAW9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnn3Q9DAW9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnn3Q9DAW9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnn3Q9DAW9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnn3Q9DAW9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnn3Q9DAW9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnn3Q9DAW9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnn3Q9DAW9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnn3Q9DAW9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn3Q9DAW9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn3Q9DAW9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn3Q9DAW9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn3Q9DAW9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn3Q9DAW9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn3Q9DAW9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn3Q9DAW9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn3Q9DAW9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn3Q9DAW9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn3Q9DAW9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn3Q9DAW9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn3Q9DAW9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn3Q9DAW9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn3Q9DAW9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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