Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TrmuQ9DAT5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TrmuQ9DAT5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TrmuQ9DAT5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TrmuQ9DAT5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TrmuQ9DAT5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TrmuQ9DAT5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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TrmuQ9DAT5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TrmuQ9DAT5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TrmuQ9DAT5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TrmuQ9DAT5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms