Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ift43Q9DA69 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ift43Q9DA69 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Ift43Q9DA69 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ift43Q9DA69 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift43Q9DA69 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift43Q9DA69 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift43Q9DA69 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift43Q9DA69 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift43Q9DA69 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift43Q9DA69 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift43Q9DA69 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift43Q9DA69 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift43Q9DA69 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift43Q9DA69 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms