Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DA42 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DA42 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DA42 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DA42 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DA42 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DA42 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DA42 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DA42 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DA42 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DA42 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DA42 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DA42 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DA42 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DA42 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DA42 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DA42 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DA42 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DA42 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DA42 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DA42 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DA42 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DA42 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DA42 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DA42 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DA42 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DA42 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DA42 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DA42 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DA42 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DA42 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DA42 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DA42 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DA42 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DA42 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9DA42 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9DA42 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9DA42 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9DA42 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9DA42 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9DA42 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9DA42 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9DA42 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9DA42 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9DA42 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9DA42 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9DA42 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9DA42 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9DA42 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9DA42 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9DA42 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9DA42 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DA42 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DA42 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DA42 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DA42 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DA42 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DA42 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DA42 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DA42 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DA42 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DA42 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DA42 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DA42 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DA42 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DA42 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DA42 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DA42 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DA42 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DA42 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DA42 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DA42 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DA42 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DA42 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DA42 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DA42 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DA42 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DA42 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DA42 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DA42 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DA42 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DA42 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DA42 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DA42 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DA42 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9DA42 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9DA42 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9DA42 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9DA42 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9DA42 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9DA42 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9DA42 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9DA42 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9DA42 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9DA42 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9DA42 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9DA42 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9DA42 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9DA42 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9DA42 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms