Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cnot8Q9D8X5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms