Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tvp23bQ9D8T4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms