Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Q9D8Q6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Q9D8Q6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Q9D8Q6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Q9D8Q6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Q9D8Q6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Q9D8Q6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9D8Q6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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