Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
2310002L09RikQ9D7L5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
2310002L09RikQ9D7L5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
2310002L09RikQ9D7L5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
2310002L09RikQ9D7L5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms