Protein–RNA interactions for Protein: Q9D735

Trir, Telomerase RNA component interacting RNase, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrirQ9D735 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TrirQ9D735 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrirQ9D735 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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