Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms