Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PudpQ9D5U5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms