Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms