Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc105Q9D4K7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms