Protein–RNA interactions for Protein: Q9D287

Bcas2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas2Q9D287 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Bcas2Q9D287 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Bcas2Q9D287 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Bcas2Q9D287 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Bcas2Q9D287 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Bcas2Q9D287 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Bcas2Q9D287 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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Bcas2Q9D287 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Bcas2Q9D287 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Bcas2Q9D287 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Bcas2Q9D287 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Bcas2Q9D287 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Bcas2Q9D287 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Bcas2Q9D287 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Bcas2Q9D287 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Bcas2Q9D287 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcas2Q9D287 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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