Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Batf3Q9D275 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Batf3Q9D275 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms