Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Ccdc47Q9D024 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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