Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf146Q9CZW6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf146Q9CZW6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms