Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ist1Q9CX00 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ist1Q9CX00 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms