Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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