Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Cnot11Q9CWN7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot11Q9CWN7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot11Q9CWN7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot11Q9CWN7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot11Q9CWN7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot11Q9CWN7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Cnot11Q9CWN7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot11Q9CWN7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot11Q9CWN7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot11Q9CWN7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot11Q9CWN7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot11Q9CWN7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot11Q9CWN7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Cnot11Q9CWN7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Cnot11Q9CWN7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot11Q9CWN7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot11Q9CWN7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot11Q9CWN7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot11Q9CWN7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot11Q9CWN7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot11Q9CWN7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot11Q9CWN7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot11Q9CWN7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot11Q9CWN7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Cnot11Q9CWN7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot11Q9CWN7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot11Q9CWN7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot11Q9CWN7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot11Q9CWN7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot11Q9CWN7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Cnot11Q9CWN7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Cnot11Q9CWN7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot11Q9CWN7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Cnot11Q9CWN7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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