Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud1Q9CUB6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms