Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NmbQ9CR53 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms