Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska2Q9CR46 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms