Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg12Q9CQY1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms