Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ifitm3Q9CQW9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ifitm3Q9CQW9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ifitm3Q9CQW9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ifitm3Q9CQW9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ifitm3Q9CQW9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ifitm3Q9CQW9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ifitm3Q9CQW9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ifitm3Q9CQW9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ifitm3Q9CQW9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ifitm3Q9CQW9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ifitm3Q9CQW9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ifitm3Q9CQW9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ifitm3Q9CQW9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifitm3Q9CQW9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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