Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS5

Riok2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok2Q9CQS5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms