Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQM1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9CQM1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQM1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQM1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQM1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQM1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQM1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQM1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQM1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQM1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQM1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQM1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQM1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQM1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQM1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQM1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQM1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQM1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQM1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQM1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQM1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQM1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQM1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQM1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQM1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQM1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQM1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQM1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQM1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQM1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQM1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQM1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQM1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQM1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms