Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms