Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ccdc198Q9CPZ1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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