Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms