Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ3

Tomm22, Mitochondrial import receptor subunit TOM22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm22Q9CPQ3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tomm22Q9CPQ3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tomm22Q9CPQ3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tomm22Q9CPQ3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tomm22Q9CPQ3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tomm22Q9CPQ3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tomm22Q9CPQ3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tomm22Q9CPQ3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tomm22Q9CPQ3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tomm22Q9CPQ3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tomm22Q9CPQ3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tomm22Q9CPQ3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tomm22Q9CPQ3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tomm22Q9CPQ3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tomm22Q9CPQ3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tomm22Q9CPQ3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tomm22Q9CPQ3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms