Protein–RNA interactions for Protein: Q99PH1

Lrrc4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc4Q99PH1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc4Q99PH1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms