Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rassf3Q99P51 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rassf3Q99P51 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms