Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rims1Q99NE5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms