Protein–RNA interactions for Protein: Q99MQ3

Pink1, Serine/threonine-protein kinase PINK1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pink1Q99MQ3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pink1Q99MQ3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms