Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms