Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Rcbtb2Q99LJ7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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