Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms