Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q99KU6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q99KU6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q99KU6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q99KU6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q99KU6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q99KU6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q99KU6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q99KU6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q99KU6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q99KU6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q99KU6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q99KU6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q99KU6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q99KU6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q99KU6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q99KU6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q99KU6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q99KU6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q99KU6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q99KU6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q99KU6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q99KU6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q99KU6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q99KU6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q99KU6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q99KU6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q99KU6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q99KU6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q99KU6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q99KU6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q99KU6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q99KU6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q99KU6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q99KU6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q99KU6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q99KU6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q99KU6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q99KU6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q99KU6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q99KU6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q99KU6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q99KU6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q99KU6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q99KU6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q99KU6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q99KU6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q99KU6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q99KU6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q99KU6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q99KU6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q99KU6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q99KU6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q99KU6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q99KU6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q99KU6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q99KU6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q99KU6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q99KU6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q99KU6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q99KU6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q99KU6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q99KU6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q99KU6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q99KU6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q99KU6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q99KU6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q99KU6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q99KU6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q99KU6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q99KU6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q99KU6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q99KU6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q99KU6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q99KU6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q99KU6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q99KU6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q99KU6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q99KU6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q99KU6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q99KU6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q99KU6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q99KU6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q99KU6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q99KU6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q99KU6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q99KU6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q99KU6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q99KU6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q99KU6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q99KU6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q99KU6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q99KU6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q99KU6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q99KU6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q99KU6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q99KU6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q99KU6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q99KU6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q99KU6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms